Malmö huskyrka är ingen kyrka i ordets vanliga bemärkelse. Den är en samlingspunkt för olika husförsamlingar i Malmöregionen. De husförsamlingar som är med i Malmö huskyrka är var för sig autonoma församlingar, som dock står under Malmö huskyrkas försyn och stöd.

En husförsamling är en gemenskap av kristna som har överlåtit sig till Kristus och till varandra. Gemenskapen baseras på ett ”öppet hem”, och kan till exempel ta sig i uttryck i regelbunden, gemensam bön, att man uppmuntrar varandra till ett tjänande liv och på olika sätt betjänar sitt område. Målet är att alla människor ska få lära känna och följa efter Jesus.

Malmö huskyrka vill vara ett nätverk av små organiska gemenskaper av kristna som lever ut den kristna tron i vardagen, ber för och på olika sätt betjänar sin stad och sitt område. Det dessa husförsamlingar håller på med har många namn. På vissa håll kallas det husförsamlingsrörelsen, på andra håll Simple Church, Organic Church, kommunitetsrörelsen eller den nymonastiska rörelsen.